Identification and characterization of notch3 as a new asymmetric factor during heart looping - Thèses de Sorbonne Université
Thèse Année : 2022

Identification and characterization of notch3 as a new asymmetric factor during heart looping

Identification et caractérisation de notch3, un nouveau facteur asymétrique au cours de la boucle cardiaque

Résumé

Left-right asymmetry of the heart is essential for establishing the double blood circulation : abnormal left-right patterning of the embryo leads to congenital heart defects in the heterotaxy syndrome. Whereas the heart initially forms as a straight tube, it acquires an asymmetric helical shape during the process of heart looping. This is a key step of heart morphogenesis, during which cardiac chambers are aligned, as a prerequisite for the correct plumbing of the blood circulation. Although the left determinant NODAL is an important regulator of heart looping, previous work in the lab has shown that it is not the only asymmetry factor, but that NODAL plays a key role in biasing and amplifing pre-existing asymmetries. Yet, asymmetries other than NODAL signaling have remained unclear. In order to investigate the left-right patterning of cardiac precursors, we designed a transcriptomic approach to screen for differential gene expression in the left and right heart fields of the mouse embryo. The transcriptional screen has been performed in individual embryos, at seven sequential stages of heart looping. From an initial pilot screen, we have identified Notch3 as a novel asymmetric gene. State-of-the-art 3D spatio-temporal quantitative mapping of Notch3 expression revealed that it was transiently expressed in the left lateral plate mesoderm, containing heart precursor cells, before heart looping. We found that Notch3 was co-expressed with Nodal within this population and that Notch3 asymmetry was amplified by NODAL signaling, providing the first molecular evidence that NODAL acts as an amplifier of asymmetry. Given that the mouse has four paralogue Notch receptors, we have investigated potential redundancy between them. From published single cell RNA sequencing and new quantitative mapping, we observed specific expression patterns : Notch4 expression was negligible, that of Notch1 was restricted to the endocardium and dorsal aortae, whereas Notch2 was expressed in heart progenitors and enriched in the juxta-cardiac field, where Notch3 is low. We have not detected any obvious asymmetry of other Notch. In Notch3 mutant heart fields, Notch1 and Notch2 were found upregulated, thus indicating potential compensation. To elucidate the contribution of Notch3 to heart looping, we have adopted three approaches. We have generated Notch3 mutants at E9.5 to quantify anomalies in heart looping. We have crossed Notch3 mutants with Nodal mutants, to assess interaction between these two asymmetric genes. Finally, to overcome compensation by other Notch paralogues, we will treat Notch3 mutants with a subphenotypic dose of gamma-secretase inhibitors and assess whether it worsens heart looping defects. These functional experiments are ongoing. During this project, we have developed novel tools to screen and quantify asymmetric gene expression in cardiac precursors. We will discuss the discovery of Notch3 in the context of left-right asymmetry and heart development. By analogy with the role of Notch3 in other tissues, we will discuss cellular mechanisms regulated by Notch3. Altogether, this work provides novel insight into the mechanisms of left-right asymmetric organogenesis.
L’asymétrie droite-gauche du cœur est essentielle à l’établissement de la double circulation sanguine : des anomalies dans l’information de position droite-gauche dans l’embryon entraînent des malformations cardiaques congénitales dans le syndrome d’hétérotaxie. Alors que le cœur se forme initialement comme un tube droit, il acquiert une forme hélicoïdale asymétrique au cours du processus de la boucle cardiaque. Il s’agit d’une étape clé de la morphogenèse cardiaque, au cours de laquelle les cavités cardiaques sont alignées, condition préalable à la bonne plomberie de la circulation sanguine. Bien que le déterminant gauche NODAL soit un régulateur important de la boucle cardiaque, des travaux antérieurs en laboratoire ont montré qu'il n'est pas le seul facteur d'asymétrie, de sorte que NODAL biaise et amplifie des asymétries préexistantes. Pourtant, les asymétries autres que la signalisation NODAL sont restées floues. Afin d'étudier l’information de position droite-gauche des précurseurs cardiaques, nous avons conçu une approche transcriptomique pour mettre en évidence l'expression différentielle des gènes dans les champs cardiaques droit et gauche de l'embryon de souris. Le crible transcriptionnel a été réalisé sur des embryons individuels, à sept stades séquentiels de la boucle cardiaque. À partir d'un crible pilote initial, nous avons identifié Notch3 comme un nouveau gène asymétrique. La cartographie spatio-temporelle de pointe, quantitative et en 3D, de l'expression de Notch3 a révélé une expression transitoire dans le mésoderme de la plaque latérale gauche, contenant des cellules précurseurs cardiaques, précédent le stade de la boucle cardiaque. Nous avons montré que Notch3 était co-exprimé avec Nodal au sein de cette population et que l'asymétrie de Notch3 était amplifiée par la signalisation NODAL, fournissant la première preuve moléculaire que NODAL agit comme un amplificateur d'asymétrie. Étant donné que la souris possède quatre récepteurs Notch paralogues, nous avons étudié la redondance potentielle entre eux. À partir de données publiées de séquençage d'ARN en cellules uniques et de nouvelles cartographies quantitatives, nous avons observé des profils d'expression spécifiques : l'expression de Notch4 est négligeable, celle de Notch1 est limitée à l'endocarde et à l'aorte dorsale, tandis que Notch2 est exprimé dans les progéniteurs cardiaques et enrichi dans le champ juxta-cardiaque, où le niveau de Notch3 est bas. Nous n'avons pas détecté d’asymétrie évidente des autres Notch. Dans les champs cardiaques des mutants Notch3, Notch1 et Notch2 ont été trouvés surexprimés, indiquant ainsi une compensation potentielle. Pour élucider la contribution de Notch3 à la boucle cardiaque, nous avons adopté trois approches. Nous avons généré des mutants Notch3 à E9.5 pour quantifier les anomalies de la boucle cardiaque. Nous avons croisé les mutants Notch3 avec les mutants Nodal, pour évaluer l'interaction entre ces deux gènes asymétriques. Enfin, pour surmonter la compensation par d'autres paralogues de Notch, nous traiterons les mutants Notch3 avec une dose sub-phénotypique d'inhibiteurs de la gamma-sécrétase et évaluerons si cela aggrave les défauts de la boucle cardiaque. Ces expériences fonctionnelles sont en cours de réalisation. Durant ce projet, nous avons développé de nouveaux outils pour cribler et quantifier l'expression asymétrique des gènes dans les précurseurs cardiaques. Nous discuterons de la découverte de Notch3 dans le contexte de l'asymétrie droite-gauche et du développement cardiaque. Par analogie avec le rôle de Notch3 dans d'autres tissus, nous aborderons les mécanismes cellulaires régulés par Notch3. Dans l’ensemble, ce travail fournit un nouvel éclairage sur les mécanismes de l'organogenèse asymétrique droite-gauche.
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Origine Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-04748545 , version 1 (22-10-2024)

Identifiants

  • HAL Id : tel-04748545 , version 1

Citer

Tobias Holm Bønnelykke. Identification and characterization of notch3 as a new asymmetric factor during heart looping. Development Biology. Sorbonne Université, 2022. English. ⟨NNT : 2022SORUS556⟩. ⟨tel-04748545⟩
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