Mon travail de thèse a été de développer une technique de microscopie la moins phototoxique possible, tout en améliorant le sectionnement optique, sur les bases de l'illumination structurée. En effet, la microscopie d'illumination structurée SIM (Structured Illumination Microscopy) est une technique permettant de séparer le signal d'intérêt modulé, du bruit de fond non modulé provenant des plans hors focus. Pour cela il est nécessaire de projeter un motif, qui peut être un réseau, sur l'échantillon. La présence du réseau va moduler uniquement le signal d'intérêt au plan focal. Pour démoduler le signal d'intérêt, il est important d'avoir le plus possible de phases et d'angles différents de ce réseau. Cela entraine proportionnellement la création d'un grand nombre d'images et parallèlement l'augmentation de l'énergie lumineuse reçue par l'échantillon ce qui augmente la phototoxicité. Ainsi, nous avons tenté de limiter au maximum le nombre d'images nécessaires à la démodulation du signal, en regroupant le minimum d'information sur un seul temps de pause de la caméra, ce qui a eu pour effet de rendre le système moins phototoxique pour les échantillons, tout en gagnant en contraste et en résolution.